MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP03

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013264	ATGAC	2	10	12	21	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013264	CCT	2	6	23	28	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013264	GCG	2	6	63	68	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013264	AGAT	2	8	91	98	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013264	GGCT	2	8	209	216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013264	AAG	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013264	CAA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013264	GCA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013264	GTG	2	6	426	431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013264	AACG	2	8	480	487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013264	CGCTC	2	10	501	510	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013264	CAC	2	6	529	534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013264	T	7	7	548	554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013264	ACG	2	6	577	582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013264	ATA	2	6	620	625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013264	GGAC	2	8	699	706	25 %	0 %	50 %	25 %	259647807
17	NC_013264	CAGC	2	8	734	741	25 %	0 %	25 %	50 %	259647807
18	NC_013264	CGGC	2	8	753	760	0 %	0 %	50 %	50 %	259647807
19	NC_013264	ACAG	2	8	812	819	50 %	0 %	25 %	25 %	259647807
20	NC_013264	CTG	2	6	833	838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647807
21	NC_013264	GGCG	2	8	892	899	0 %	0 %	75 %	25 %	259647807
22	NC_013264	GCG	2	6	963	968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647807
23	NC_013264	TGCGA	2	10	988	997	20 %	20 %	40 %	20 %	259647807
24	NC_013264	GGC	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647807
25	NC_013264	GCG	2	6	1050	1055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647807
26	NC_013264	CTG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647808
27	NC_013264	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647808
28	NC_013264	CAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647808
29	NC_013264	GGC	2	6	1353	1358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647808
30	NC_013264	AT	3	6	1427	1432	50 %	50 %	0 %	0 %	259647808
31	NC_013264	TGC	2	6	1444	1449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647808
32	NC_013264	TTA	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647808
33	NC_013264	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647808
34	NC_013264	A	6	6	1577	1582	100 %	0 %	0 %	0 %	259647808
35	NC_013264	GCAGAT	2	12	1596	1607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	259647808
36	NC_013264	TGG	2	6	1637	1642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647808
37	NC_013264	AAG	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647808
38	NC_013264	AG	3	6	1662	1667	50 %	0 %	50 %	0 %	259647808
39	NC_013264	TA	3	6	1700	1705	50 %	50 %	0 %	0 %	259647808
40	NC_013264	CAA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013264	CTT	2	6	1739	1744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013264	A	7	7	1747	1753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013264	CAG	2	6	1859	1864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647809
44	NC_013264	GGAAG	2	10	1876	1885	40 %	0 %	60 %	0 %	259647809
45	NC_013264	CAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647809
46	NC_013264	TCC	2	6	1954	1959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259647809
47	NC_013264	T	6	6	1987	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	259647809
48	NC_013264	CTT	2	6	2000	2005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647809
49	NC_013264	CGA	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647809
50	NC_013264	CTT	2	6	2048	2053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647809
51	NC_013264	T	6	6	2052	2057	0 %	100 %	0 %	0 %	259647809
52	NC_013264	T	6	6	2130	2135	0 %	100 %	0 %	0 %	259647809
53	NC_013264	TTTAT	2	10	2140	2149	20 %	80 %	0 %	0 %	259647809
54	NC_013264	CGC	2	6	2241	2246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647809
55	NC_013264	AC	3	6	2273	2278	50 %	0 %	0 %	50 %	259647809
56	NC_013264	TTC	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647809
57	NC_013264	CTGT	2	8	2345	2352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013264	A	6	6	2428	2433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013264	GCA	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013264	CTGA	2	8	2512	2519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013264	ACC	3	9	2577	2585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647810
62	NC_013264	GCT	4	12	2618	2629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647810
63	NC_013264	CTCGAT	2	12	2646	2657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	259647810
64	NC_013264	GAACGG	2	12	2747	2758	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	259647810
65	NC_013264	CGG	2	6	2828	2833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013264	AT	4	8	2986	2993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013264	GTC	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.